郑成功祖庙里的郑成功神像很有质感。祖庙于1663年由郑经兴建，原名延平王庙，后因清廷禁止民间
祭祀郑成功，改为郑氏宗祠。1874年，沈葆桢上书朝廷拨款将其改成延平郡王祠。
明郑王朝的信仰体系
寺庙的历史往往来自传说，不大可靠。经过仔细考订，有学者认为明郑时期台湾并没有妈祖庙，郑成功信仰的海神是玄天上帝。妈祖是诞生于福建莆田湄洲岛的女神，在元朝封天妃、清朝封天后，唯独在明朝最受冷落。明朝倒是有一个叫玄天上帝（又称真武帝君、上帝公、北帝）的北方之神，先是帮助过朱元璋开国，后又辅助明成祖夺取政权，成为明朝统治者大力表彰的守护神，载入国家祀典。闽南各地崇祀玄天大帝的庙宇不少。玄天上帝是北极星的人格化，因此也成为明代主要的航海神，势力之大，当时恐怕还要超过妈祖。
攻下普罗民遮城之后，郑成功在市镇最高的鹫岭北坡征收了一家汉医馆，起建主祀玄天大帝的北极殿，北极星在北，所以寺庙坐南朝北。
此时围困热兰遮城的战役仍在进行。或许郑成功认为，是玄天大帝助他潮水，才如此急切地答谢神恩。
郑成功于来台第二年（1662）病逝，只有39岁，但他奠定了明郑政权在台湾的基础。其子郑经继位，因为失去了大陆沿海岛屿，只好专注于台湾的屯垦开发，建立典章制度。陈永华是郑经的老师，明秀才，忍不住要在台湾复制华夏礼制，建议郑经建文庙、办学校、搞科举。
1666年正月，先师圣庙与国学建成，郑经亲率文武百官吃斋行礼，举办了台湾第一次祭孔大典，标志着中华文化在宝岛落地生根，参与者都激动得热泪盈眶。台南孔庙被称为“全台首学”，至今每年遵古礼都要举办春秋二祭。这些仪式，在大陆早已失落，真是“礼失求诸野”啊。
作为政权的补充，阴间政府体系也是不能省略的，1669年郑经创建承天府城隍庙（后为台湾府城隍庙），也是全台第一座城隍庙。那是一个开天辟地的时代，无论建造什么，都属于首创。府城隍庙门厅高悬一方“尔来了”的匾额，那冷冷的口气，传达出一股慑人的气势。中国人相信，人死后魂魄先要到城隍庙报到，善有善报，恶有恶报，纵使你躲过了人间法网，终究逃不脱城隍爷的冥间审判。
城有城隍，乡有土地。土地公相当于村长里长，通常形象是一个面容和善的白胡子老人，戴着乌纱帽，又叫福德正神。土地公官卑庙小，惟以数量取胜，随处皆有。府城里最有名的土地庙大约是番薯崎小南天福德祠了。姓邱的庙祝说，该庙建于明郑时期，“小南天”三字原是宁靖王题写的，后来丢失了，请林朝英补写。
他请我注意土地公头上的帽子：“过去有说法，地方上出了状元，土地公就可以戴宰相帽，皇帝加封他一品官。”
我仔细一看，果然不是寻常的乌纱帽，而是缀满红缨的金冠。我说：“好像台湾没出过状元啊？”“番薯崎没状元，可是出了一个总兵，叫曾元福，也相当于状元，所以土地公戴上了宰相帽。不过——”他沮丧地补充，“现在很多土地公都戴宰相帽，乱了。”
我打听这尊土地公有没有大陆祖庙，他说：“土地公与其他神不一样，有地就有神，不需要祖庙。”郑氏三代统治台湾22年，移植大陆原乡的神灵，首先在台南建立起一个信仰体系。一个初到台湾的新移民，尽管举目无亲，但这些神灵他是熟悉的，他不会因孤独而绝望。这个信仰体系后来由历代台湾统治者继承、增减和调整，遗留到今天。府城是台湾祠祀最早、庙宇最密集、神灵最众多的城市，是台湾民间信仰的中心。
